Näytetään tekstit, joissa on tunniste Oslon yliopisto. Näytä kaikki tekstit
Näytetään tekstit, joissa on tunniste Oslon yliopisto. Näytä kaikki tekstit

lauantai 7. marraskuuta 2020

Sonjan pohjoismaisia kuvioita

Eilen, 6. marraskuuta, liput liehuivat Kustaa II:n Adolfin muistolle ja ruotsalaisuudelle. Ruotsin kielen ja kulttuurin päivänä se on noteerattu meidän perheessä vahvasti siitä asti, kun tytär avioitui suomenruotsalaisen nuoren miehen kanssa. Aikoinaan ruotsinsuomalaisiin perehtyessäni olin kerran vävyn isän kanssa juhlassa, jonka pitopaikkana toimi vävyn ja hänen veljiensä koulu Tampereella. Hain vaikutteita Suomen oman kielivähemmistön juhlatavoista vertailuaineistoksi ruotsinsuomalaisten keskuudessa kehkeytyviin tapoihin. Unohtumaton reissu!

Tänä vuonna juhlapäivässä painottuu tyttären ja vävyn perheen esikoisen väitöstilaisuus. Koronatilanteen takia paikan päälle Osloon ei ollut menemistä, mutta Zoom-yhteys tarjosi mahdollisuuden tutkimuksen julkisen tarkastamisen mainiosti niin, että kotiyleisö otettiin huomioon. Tekniikka pelasi kakistelematta.

Kuvaruudulla näkyy naamoja. Ylänurkassa oikealla yläviistoon katsoo väittelijä, Sonja Lagström, joka minulle on ensisijaisesti lapsenlapsi. Tutkimuksen ykköstarkastaja, professori Jesper Hansen Bonde Kööpenhaminasta, vilkuttaa kuvan alalaidassa. Vasemmassa ylänurkassa näkyy kakkostarkastajana toiminut professori  Joakim Dillner  Karoliinisesta instituutista Tukholmasta, Sonjan kuvan alapuolella on apulaisprofessori Anne Cathrine Staff  Oslon yliopistosta, samoin puhetta viran puolesta johtanut  Anne Olaug Olsen Joakimin kuvan alapuolella. Välillä kuvissa näkyi myös tekniikassa avustanut Birgit Skjölvik.

 Kotikatsomossa seurattiin tiiviisti kuvaruudun näkymiä ja kuunneltiin puheenvuoroja. Sonja puhkesi puhumaan vuoron saatuaan:

 MSc Sonja Helena Lagstrøm at Institute of Clinical Medicine will give a trial lecture on the given topic: Tracking the COVID19 pandemics using next generation sequencing (NGS)  - sequence variants in the Nordic Countries.

Aihe on loitolla omista osaamisistani. Kumma kyllä, luulen ymmärtäneeni, ehkä jopa oppineeni yhtä ja toista. Kiitos, Sonja, selkeästä esityksestä. VV (Vakituinen Vierailija) taisi saada irti alkuluennosta melkoisesti, sillä hänen myöhäisten vuosien harrastuksiinsa on palannut solubiologia. 


Pian kuultiin, että alkuluento on hyväksytty, ja päästiin tunniksi tauolle. Meillä nautittiin hernekeittoa ja pannukakkua, huilattiin tovi ja istahdettiin taas ruudun ääreen. Yhteyden palattua Jesper aloitti osuutensa Kööpenhaminasta. Tutkimus ja raportti siitä otettiin lähisyyniin.
 

 
 
 Käytiin läpi tutkimuksen aihe, ongelmat, aineistot, menetelmät, tilastot ja tulokset. Ykköstarkastajana Jesper vakuutti paitsi asiantuntemuksellaan myös selkeällä englannillaan ja väittelijää arvostavalla asenteellaan. Sinuttelu korosti kollegiaalisuutta. Huolellisesti Jesper nosti tarkasteltavaksi monia sellaisia seikkoja, joista myös kotikatsomo hyötyi, Saimme aimo annoksen oppia siitä, kuinka papilloomavirus varioi itseään. Rokottaminen sitä vastaan on puhdistanut Pohjoismaat ja osin Länsi-Euroopan kohdunkaulan syövästä. Tämä naisten vitsaus riivaa edelleen Afrikassa, jossa Sonja on tavannut sikäläisen alan tutkijan ja saanut häneltä aineistoa käyttöönsä. Taudin levinneisyyskartat olivat synkkää katsottavaa. 
 
Jesper tarjosi Sonjalle pähkinän purtavaksi: pitäisikö papilloomavirusten lisätutkimuksista luopua, kun meillä Pohjoismaissa niiden haitat on jo pääosin torjuttu, vai jatkaa tutkmuksia, jotta muuallakin  päästäisiin kohdunkaulan syövistä? Virusten muuntelevuus puolustaa tutkimusten jatkamista, samoin se, että kustannukset ovat perin vähäisiä verrattuna vaikkapa ponnistuksiin Covid-19:n torjumiseksi. 

 Paljon oli puhetta myös uusista sekvensointitekniikoista. Niistä erästä tiettyä Sonja on ollut kehittämässä pitkään. Vuonna 2018 Oslossa julkaistussa ensimmäisessä artikkelissa (TaME-seq: An efficient sequencing approach for characterisation of HPV genomic variability and chromosomal integaration) menetelmä ja sillä saadut hyödyt entisiin menetelmiin verrattuna on esitelty tarkasti.

Kakkostarkastaja kiinnitti erityisesti huomiota vain yhteen kolmesta artikkelista. Hiukan mutinoita aiheuttivat tilastolliset tulkinnat. Mitään varsinaisia moitteita en huomannut esitettävän, päinvastoin. Yleisökysymyksiä tuli vain yksi: Sonjan isä viittasi itselleen puheenvuoron, joka auliisti annettiin. Hän muistutteli tytärtä yhteisestä pubi-illasta Trondheimissä melko hiljakkoin. Vaimokin sai tilaa tervehtimiseen. Hauskalta kuulosti. Iloisiin onnitteluihin päättyi tämä merkittävä yhteispohjoismainen Zoom-konferenssi. Whatsapp-ryhmässä viestit olivat vingahdelleet jo tarkastuksen kuluessa, kunnes komeaksi lopuksi kotikatsomoissakin päästiin naputtelemaan onnitteluja Sonjalle.

Kolmostarkastaja ei enää tuonut mitään uutta esiin työstä, sillä hän on toiminut viran puolesta prosessin aikatauluttajana ja sihteerinä. Hän ilmaisi tuntevansa Sonjan ja mainitsi muun muassa illalla odottavasta juhlasta, johon itsekin aikoi osallistua. Perinteisen väitöskaronkan asemesta iltajuhla toteutettiin Sonjan läksiäisten merkeissä. Hänen kolmivuotinen, yhden äitiysloman katkaisema tutkimushankkeensa on päätöksessään. Hommansa hoitaneena tutkijana hän on vapaa lähtemään, vaikka olisi voinut jäädä osaksi laitoksen henkilökuntaa. 

Väitösurakasta Sonja siirtyy oikopäätä äitiyslomalle odottamaan poikavauvan putkahtamista omin käsin hoidettavaksi kotona Uppsalassa. Sinne hän ennättää tänään iltapäivällä. Sonjan puolisolle ja Hildan kelpo isälle, Gustafille, lyckönskningar från andra sidan Bottenviken. Det är pappans dag i morgon! Hoppas du får både puss och kram ock även god frukost i morgon bitti. Kyss på skinden Hilda också. Vila ut nu hela familjen! Tänker varmt på er alla...

Oli mukava seurata kotoa käsin tukimuksen julkista tarkastusta. Prosessi sujui. Kaikki ruudulta nähdyt henkilöt tuntuivat olevan tehtävänsä tasalla ja puhuivat koko lailla selvästi englantiaan, Sonja jopa ällistyttävän hyvin, takeltelematta. Virustutkimus on niin kansainvälistä, että työ- ja julkaisukielenä väistämättä on jokin iso maailmankieli, kuten englanti. Pidetään silti lippua korkealla myös suomen kielen puolesta käyttämällä sitä sekä lähikontakteissa että tieteen kielenä. Kunpa Sonjan tutkimuksen keskeiset tulokset julkaistaisiin myös suomeksi!

 


 


keskiviikko 28. lokakuuta 2020

Ponnekas ehtii, jaksaa ja pääsee maaliin


 Perhepiirissä on hyvän aikaa iloittu Sonjan saavutuksista. Keväällä näet kuultiin, että hänen väitöskirjaksi aiottu tutkimuksensa on hyväksytty. Onnittelumaljat skoolattiin etänä, koska Sonja perheineen oli muuttamassa Oslosta Uppsalaan. Väitöstilaisuus oli luvassa elokuulle, jolloin minunkin piti reissata Oslon yliopistosairaalan todistamaan tapahtumaa, kuten syksyllä 2019 kuviteltiin.

Mutta, mutta - sitten koronavirus puuttui peliin ja iski meidät kaikki kanveesiin. Seurasi kaikkialla maailmassa ihmisten sairastumisia kuolettavasti, uhkaa sairaalakapasiteetin loppumisesta, matkustusrajoituksia, karanteeneja, taistelua maskeista ja muuta kurjuutta. Väitöstilaisuutta oli siirrettävä. Lopulta päivämääräksi ilmoitettiin marraskuun 6. 2020. Tiukalle meni, sillä Sonja odottaa perheen toista lasta, jonka on määrä syntyä joulukuun vaihteessa.

Live-tilaisuuden asemesta meidän paikalle kutsuttujenkin on tyytyminen Zoom-verkkoneuvotteluohjelman kautta todistamaan, että Sonja on hommansa hoitanut. Tilaisuus on hyvään akateemiseen tapaan julkinen. Niinpä siihen voi osallistua, jos aihe ja asia kiinnostavat. Aikataulu ja linkit tässä:

Digital Public Defence: Sonja Lagstrøm

MSc Sonja Helena Lagstrøm at Institute of Clinical Medicine will be defending the thesis “Characterisation of human papillomavirus genomic variation and chromosomal integration in cervical samples” for the degree of PhD (Philosophiae Doctor).

The public defence will be held as a video conference over Zoom.

The defence will follow regular procedure as far as possible, hence it will be open to the public and the audience can ask ex auditorio questions when invited to do so.

Click here to participate in the public defence

Download Zoom here

Order a digital copy of the thesis here

Norjassa väitöstilaisuudet poikkeavat suomalaisista ainakin siltä osin, että tutkimusaiheeseen liittyvän parikymmentä minuuttia kestävän lectio praecursorian asemesta väittelijä luennoi tunnin aiheesta, jonka vastaväittäjä(t) antaa tutkimuksen pohjalta. Sonjan aiheena on

Tracking the COVID19 pandemics using next generation sequencing (NGS)  - sequence variants in the Nordic Countries.

The public defence will be held as a video conference over Zoom.

The defence will follow regular procedure as far as possible, hence it will be open to the public and the audience can ask ex auditorio questions when invited to do so.

Click here to participate in the trial lecture

Download Zoom here

Tutkimuksen yhtenä tuloksena on kehitetty geenien sekvensointimenetelmä, jolle on haettu patenttia. Menetelmän avulla voidaan tutkia HPV:n perimän muutoksia ja näin saada tarkempaa tietoa kohdunkaulan syövän riskitekijöistä ja synnystä. 

-----

Typykässä on piisannut puhtia vauvasta asti.

 

Isovanhempien ilona Kangasalla Sonja huseerasi usein yhdessä siskojensa ja kahden serkkunsa kanssa. Tilaa temmeltämiseen riitti niin talossa kuin pihalla. Ei ole liikaa haitannut, vaikka osa porukasta tuntui ja edelleen tuntuu aina asuvan muualla kuin Suomessa. Kesäisin kotimaa veti puoleensa jopa maapallon toiselta laidalta. Sonjan eno perheineen asui pitkään Australiassa, Hongkongissa ja Sveitsissä. Aikoinaan reissuun lähti kaksi, mutta kotiin palasi neljä. Niin onnekas oli se matka!

Ennen kuin muista lastenlapsista edes uneksittiin, Sonja valloitti kaikki isovanhempansa. Lasta ihailtiin. Hauskaa oli läheltä seurata, kuinka esimerkiksi meidän sisäpihan kattopalkkiin kiinnitetty hyppykiikku innosti pomppimaan. Lattiatasolta ihmettä kuvasi äidinisä. Kuvassa häämöttää muitakin kannustavia taustahahmoja: pöydän ympäillä istuivat isänisä ja -äiti, kaiketi myös minä, ellen häärännyt kahvitarjoilun parissa.




Sonjalle Norja tuli tutuksi eka kertaa isä-Leon parin kolmen vuoden työkomennuksen aikoihin, jolloin koko poppoo asui Kristiansundissa. Siellä perheeseen syntyi yksi tyttö lisää. Ei siis ihme, että Sonjalle luontui mainiosti käydä oman alan työkeikoilla Oslon yliopiston Kliinisen lääketieteen instituuttissa, kunnes hänet kelpuutettiin sinne tohtorikoulutettavaksi. Valmiudet tutkimustyöhön Sonja hankki paitsi monipuolisista yliopisto-opinnoista Suomessa ja Ruotsissa myös työvuosina Suomen molekyylibiologian laitoksella Helsingissä. Norjan pesti kesti neljättä vuotta. Tutkimustyön loppuvaiheessa syntyi Sonjan ja Gustafin esikoinen Hilda. Nyt jännitetään lähes valmiin poikavauvan mahassa pysymistä riittävän pitkään. Oi, elämän kukoistusta! 

Toivotan onnea kaikkiin lähiaikojen käänteisiin...